'명탐정 코난: 마리오네트 교향곡'은 아오야마 고쇼의 원작 '명탐정 코난'을 모티브로 한 게임으로 '명탐정 코난: 과거로부터의 전주곡'의 후속작이다. 테러리스트에 점령된 거대 시설 '스카이 클로버'에서 발생한 흉악 사건을 주인공 에도가와 코난과 모리 란, 그리고 소년탐정단 멤버들이 도전한다는 내용을 담았다. '명탐정 코난: 마리오네트 교향곡'은 주인공 에도가와 코난 뿐 아니라 다른 캐릭터 시점에서 사건을 추리하거나 특정 캐릭터의 행동에 따라 다른 캐릭터에 영향을 미치는 '재핑' 시스템을 탑재했다

• 명탐정 코난: 팬텀 광시곡
• 명탐정 코난: 푸른 보석의 윤무곡
• 명탐정 코난: 과거로부터의 전주곡